<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Medical Laboratory Journal</title>
<title_fa>Medical Laboratory Journal</title_fa>
<short_title>mljgoums</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://mlj.goums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2538-4449</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2538-4449</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/mlj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2013</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه روش طیف سنجی جرمی MALDI-TOF با روش های ملکولی و بیوشیمیایی در شناسایی انتروکوکوس فسیوم و انتروکوکوس فکالیس جداشده از نمونه های بیمارستانی</title_fa>
	<title>Comparing MALDI-ToFMass Spectrometry with Molecular and Biochemical Methods in Identifying Enterococcus Faecium and Enterococcus FaecalisIsolated from Clinical Samples</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>تحقيقي</content_type_fa>
	<content_type>Original Paper</content_type>
	<abstract_fa>زمینه و هدف: انتروکوکوس ها باکتری‌های گرم مثبتی هستند که به عنوان فلور نرمال در روده انسان، محصولات لبنی و محیط اطراف حضور دارند ولی در سال‌های اخیر به عنوان یک بیماریزای مهم فرصت طلب در عفونت‌های بیمارستانی ظهور کرده‌اند. در این مطالعه به بررسی و مقایسه کارآمدی روش نوین طیف سنجی جرمی M‏ALDI-TOFدر انتروکوکوس فکالیس و انتروکوکوس فسیوم پرداخته شده است و با روش‌های بیوشیمیایی و ملکولی مورد استفاده در تشخیص مقایسهشده است.
روش بررسی: 75 نمونه کلینیکی مشکوک به انتروکوکوس جهت بررسی بیوشیمیایی، ملکولی و طیف سنجی جذبی انتخاب شدند و با آزمون‌های بیوشیمیایی هیدرولیز اسکولین، کاتالاز، وجود پیرولیدونیل آمینوپپتیداز، رشد در مجاورت 5/6% نمک، حرکت، رشد در محیط حاوی04/0% تلوریت، و تست قندهای ال-آرابینوز و سوربیتول مورد بررسی قرار گرفتند. سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی بوسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز مورد بررسی و با استفاده از دستگاه طیف سنجی جرمی و نرم افزار بیوتایپر مورد تحلیل قرار گرفتند.
یافته ها: در 30 نمونه انتروکوکوس فسیوم، در 42 نمونه انتروکوکوس فکالیس و در 3 نمونه عفونت با هر دو باکتری شناسائی شدند. در روش‌های بیوشیمیایی 2 نمونه انتروکوکوس فسیوم تست آرابینوز منفی و در یک نمونه انتروکوکوس فکالیس تست تلوریت منفی بود. در بررسی با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز تمامی نمونه‌ها به درستی تشخیص داده شدند ولی در 2 نمونه با وجود تکرار، باندهای قابل افتراق مشهودی نداشتند. در بررسی با استفاده از طیف سنجی جرمی در تمامی نمونه‌ها تمامی آزمون‌ها و تکرارها با قابلیت افتراق بالا و به درستی شناسائی شدند.
نتیجه گیری: با توجه به نتایج این بررسی روش طیف سنجی جرمی M‏ALDI-TOfروش قابل اطمینان و دقیقی می‌باشد که در شناسائی انتروکوکوس فکالیس و انتروکوکوس فسیوم قادر به تشخیص با حساسیت 100% می‌باشد و با روش‌های بیوشیمیایی و ملکولیاز نظر سرعت اجرا و دقت قابل مقایسهمی باشد.
واژه های کلیدی: انتروکوکوس فکالیس، انتروکوکوس فسیوم، طیف سنجی جرمی، واکنش زنجیره ای پلیمراز
</abstract_fa>
	<abstract>Abstract
Background and Objective: Enterococci are Gram-positive members of human gastrointestinal flora,in Dairy products and environment. they have emerged as important causes of opportunistic nosocomial infections in recent years. In this study we aimed to investigat and compare the efficiency of MALDI-TOFmass spectroscopy method through Biochemical and Molecular methods for detecting Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium.

Materials and Methods:seventhy five clinical samples were collected for biochemical, molecular and mass spectroscopy investigations. Samples were treated with Esculin hydrolysis, Catalase, Pyrrolidonylaminopeptidase, 6.5% NaCl solution, motility, 0.04% Tellurite, L-Arabinose and Sorbitol. Using specific primesallele specific PCR was used.The samples were then analyzed by MALDI-TOF mass spectroscopy and Biotyper 3 software. 
Results:Enterococcus faecium andEnterococcus faecaliswere detected in thirty and forty two samples, respectively whereas three samples showed both bacterial infections. Using biochemical analysis, two E.faecium isolates were Arabinose negative and one E. faecalis isolates was Telliurite negative. All sampleswere showed correct bands in PCR results but twoof them didn't show clear bands(on agarose gel). In mass spectroscopy analysis all strains were correctly detected and well defined.

Conclusion: According to our results, MALDI-TOF mass spectrometry in comparison with Molecular and Biochemical Methodscould be a reliable and accurate method that can easily and quickly identify and differentiate Enterococcus faecium and Enterococcus faecalisin clinical samples. 
Key words:Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, MALDI-TOFmass spectrometry,PCR
</abstract>
	<keyword_fa>: انتروکوکوس فکالیس، انتروکوکوس فسیوم، طیف سنجی جرمی، واکنش زنجیره ای پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, MALDI-TOFmass spectrometry,PCR</keyword>
	<start_page>1</start_page>
	<end_page>6</end_page>
	<web_url>http://mlj.goums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-135&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>h</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>SamadiKafil</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa></first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین صمدی کفیل</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002294</code>
	<orcid>10031947532846002294</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>,Department of Medical Bacteriology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiatmodares University</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری شناسی پزشکی،دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>m</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>MohebatiMobarez</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa></first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اشرف محبتی مبارز</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmmobarez@modares.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002295</code>
	<orcid>10031947532846002295</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Bacteriology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiatmodares University</affiliation>
	<affiliation_fa>،گروه باکتریشناسی پزشکی،دانشکده علوم پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>m</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>ForouzandehMoghadam</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa></first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهدی فروزنده مقدم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002296</code>
	<orcid>10031947532846002296</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biotechnology, Faculty of Medical Sciences, TarbiatModares University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی دانشکده پزشکی،دانشکده علوم پزشکی،دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
